地名由來：因鎮(zhèn)人民政府駐地耿扎村，耿扎村駐地為“馬奈”而得名。
2019年，撤銷馬爾邦鄉(xiāng)、馬奈鄉(xiāng)，設(shè)立馬奈鎮(zhèn)，以原馬爾邦鄉(xiāng)和原馬奈鄉(xiāng)所屬行政區(qū)域為馬奈鎮(zhèn)的行政區(qū)域，馬奈鎮(zhèn)人民政府駐八角塘村2組87號。
歷史沿革：
馬奈鄉(xiāng)境域舊屬大金川安撫司。
清乾隆四十一年（1776年），改馬奈屯，屬河西屯守備，后屬崇化屯。
民國二十四年（1935年），崇化屯改縣，馬奈屬之。
民國二十五年（1936年），置靖化縣，設(shè)馬奈聯(lián)保。
后改馬奈鄉(xiāng)，屬第一區(qū)。
1951年7月，改馬奈鄉(xiāng)防匪生產(chǎn)委員會。
1966年，與馬爾邦合并為馬爾邦公社。
1984年，析置馬奈鄉(xiāng)。
2019年12月，撤銷馬爾邦鄉(xiāng)、馬奈鄉(xiāng)，設(shè)立馬奈鎮(zhèn)。