地名由來(lái)：因境內(nèi)有馬王廟，取“馬廟”二字得名。
2022年2月，安徽省愛(ài)國(guó)衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)委員會(huì)命名馬廟鎮(zhèn)為2021年度安徽省衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（街道）。
2021年10月，南京大學(xué)空間規(guī)劃研究中心、阿里研究院聯(lián)合發(fā)布2021年淘寶鎮(zhèn)名單，馬廟鎮(zhèn)榜上有名。
2020年12月，馬廟鎮(zhèn)入選2020年度安徽省森林城鎮(zhèn)。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘寶鎮(zhèn)，馬廟鎮(zhèn)榜上有名。
2020年4月，馬廟鎮(zhèn)上榜第五屆安徽省文明村鎮(zhèn)名錄。
與新縣城毗鄰比肩，與天柱山含情對(duì)視，與安慶市咫尺牽手，與黃鶴樓遙相佇望，這就是座落在桐、懷、潛三縣（市）交界處的懷寧縣馬廟鎮(zhèn)。全鎮(zhèn)總面積80平方公里，耕地3.2萬(wàn)畝，下轄13個(gè)行政村、3個(gè)居委會(huì)，總?cè)丝跒?.6萬(wàn)人，共設(shè)39個(gè)基層黨組織，現(xiàn)有黨員1329人。
馬廟鎮(zhèn)歷史悠久，底蘊(yùn)深厚。在舊石器時(shí)代就有人類(lèi)在此繁衍生息，經(jīng)過(guò)刀耕斧削和含辛茹血的辛勤勞作，祖祖輩輩們先后創(chuàng)造出了燦爛的文明，境內(nèi)古文化遺址遍布，古文物價(jià)值連城，其中栗崗村境內(nèi)的孫家城土城遺址，已被確認(rèn)為新石器時(shí)代文化遺存，采集的標(biāo)本有石斧、石鏟、石環(huán)、鼎足、陶片等，現(xiàn)已公布為全省第五批重點(diǎn)文物保護(hù)單位。其名稱的來(lái)歷也頗具傳奇色彩：相傳三國(guó)時(shí)期，曹操在此得太子曹丕，路過(guò)境內(nèi)蘆峰寺抽簽禱告后屢戰(zhàn)屢勝，于是殺坐騎祭祀當(dāng)?shù)氐囊蛔R，后人稱之為“馬王廟”，現(xiàn)簡(jiǎn)稱馬廟。馬廟鎮(zhèn)的前稱為育兒鄉(xiāng)，以境內(nèi)的育兒村而得名；育兒村舊稱“浴兒城”，此故事仍與曹操有關(guān)，說(shuō)他曾在此地“浴兒”，“浴”后來(lái)演變?yōu)椤坝?；?jù)考古發(fā)現(xiàn)，“浴兒城”乃一商周時(shí)期文化遺址，至今猶在，中心地帶現(xiàn)已被用于農(nóng)業(yè)綜合開(kāi)發(fā)，其護(hù)城河常年碧波綠水，魚(yú)蝦歡跳，是一處極富開(kāi)發(fā)價(jià)值的人文景觀。位于太廟村的太子墩、汪洋村的汪洋寺也是不可多得的旅游景點(diǎn)，將其納入皖西南旅游圈，必定促進(jìn)朝陽(yáng)產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展，打造地方經(jīng)濟(jì)的名片特色。
馬廟鎮(zhèn)鐘靈毓秀，物產(chǎn)富饒，歷史上素有“物華之鄉(xiāng)”、“魚(yú)米之鄉(xiāng)”的美譽(yù)。近年來(lái)，富有開(kāi)拓進(jìn)取、勇于創(chuàng)新精神的馬廟人民，對(duì)此并不滿足，他們?cè)谶@方熱土上，憑借一雙雙勤勞的大手，以特色為“指揮棒”，以科技為“點(diǎn)金術(shù)”，以服務(wù)為“保護(hù)神”，用如椽大筆寫(xiě)下了華美的篇章，現(xiàn)在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上不僅形成了“田成方、樹(shù)成行、渠相通、道相連”的全新格局，而且取得了明顯的經(jīng)濟(jì)效益、社會(huì)效益和生態(tài)效益，為農(nóng)業(yè)發(fā)展裝上了“助推器”，為農(nóng)村穩(wěn)定裝上了“穩(wěn)壓器”，為農(nóng)民增收裝上了“起飛器”；同時(shí)鎮(zhèn)黨委、政府堅(jiān)持實(shí)施工業(yè)強(qiáng)鎮(zhèn)、改革開(kāi)放、可持續(xù)發(fā)展和小城鎮(zhèn)建設(shè)等四大目標(biāo)，以民營(yíng)經(jīng)濟(jì)、園區(qū)經(jīng)濟(jì)、開(kāi)放型經(jīng)濟(jì)和特色經(jīng)濟(jì)為四大“抓手”，已經(jīng)初步形成了特種紙、板材、塑業(yè)、腸衣、化工、建材、彩印及包裝等主導(dǎo)產(chǎn)業(yè)，目前是華東地區(qū)有較大影響的板材生產(chǎn)基地之一，安徽省政府批準(zhǔn)的二十個(gè)產(chǎn)業(yè)集群之一。
孫家城遺址
孫家城遺址，位于安徽省安慶市懷寧縣馬廟鎮(zhèn)粟崗村。遺址東西長(zhǎng)約750米，南北寬約430米，東、西、南三面為環(huán)形土城，北面為大沙河，文化層厚1米—8米不等，文化堆積散布城內(nèi)，面積32萬(wàn)平方米，城
懷寧城河遺址
城河遺址位于懷寧縣馬廟鎮(zhèn)城河村。遺址四面環(huán)水，為水中小島，四周高如城墻。遺址內(nèi)文化堆積厚約1—4米不等，文化層中夾有一層沙石層，遺存中夾有砂灰陶片、灰砂紅陶片、印紋硬陶片、鼎足、鬲足等，紋飾
歷史沿革：
1945年設(shè)育兒鄉(xiāng)；1950年，分屬高河區(qū)和新安區(qū)；1958年成立育兒人民公社，后并入高河人民公社；1961年恢復(fù)育兒公社；1969年將楓林轄區(qū)并入新安公社；1984年，體制改革，新安公社改為育兒鄉(xiāng)；1992年將育兒鄉(xiāng)的新山、凌橋兩村村民委員會(huì)劃歸高河鎮(zhèn)，撤育兒鄉(xiāng)設(shè)馬廟鎮(zhèn)；2004年11月，原楓林鄉(xiāng)劃入馬廟鎮(zhèn)，屬懷寧縣管轄，地名沿用至今。