地名由來(lái)：因早期有一位叫巴吉的將軍在此帶兵打仗且修筑堡壘，故而得名。
清代設(shè)縣后為農(nóng)治社，光緒三十三年（1907）改為泰區(qū)，宣統(tǒng)二年（1910）改為巴吉壘自治鎮(zhèn)，1926年改為九區(qū)并設(shè)巴吉壘鎮(zhèn)，淪陷時(shí)期為巴吉壘村，1949年為巴吉壘區(qū)，1958年建人民公社，1983年改為鎮(zhèn)。
巴吉壘鎮(zhèn)所在地位于縣城西31公里，農(nóng)安至伏龍泉油渣公路經(jīng)此。轄太平山、雙榆樹(shù)、莫波、太和、東鐵、李家園子、南洼子、上河灣、元寶溝、四合、石頭崗子、麻花店、西鐵13個(gè)村。
鎮(zhèn)境地處波羅泡子南沿，水利資源豐富，有葦塘、上河灣2處小型水庫(kù)，3個(gè)較大天然泡塘。波羅泡子盛產(chǎn)鯽魚(yú)，鰲花、鳊花等較佳魚(yú)種也有少量出產(chǎn)，鯽魚(yú)味美有名。波羅泡子水產(chǎn)所設(shè)在該鄉(xiāng)。全鄉(xiāng)有6處較大草原，面積4.7萬(wàn)畝。年產(chǎn)牧草居全縣首位，是養(yǎng)鵝、養(yǎng)羊較多的鎮(zhèn)。礦產(chǎn)有矽砂。1985年吉林省文物考古研究所在元寶溝發(fā)掘1處新石器時(shí)期遺址。
歷史沿革：
清光緒十五年屬農(nóng)治社，清光緒三十三年屬泰區(qū)；清宣統(tǒng)二年屬十一區(qū)；1926年屬九區(qū)；1949年萌娃農(nóng)安縣巴吉壘區(qū)，1956年更名為農(nóng)安縣巴吉壘鄉(xiāng)；1958年更名為農(nóng)安縣巴吉壘公社；1983年更名為農(nóng)安縣巴吉壘鄉(xiāng)；1992年更名為農(nóng)安縣巴吉壘鎮(zhèn)，名稱一直沿用至今。