地名由來：黃碼名稱的由來相傳在清朝中時，這里交通不變，唯有一條柴米河溝，通南北水路，有一黃氏在柴米河兩岸，開設(shè)了一片糧食草行，繼而來往的船只在此泊岸，經(jīng)營糧草逐漸增多，集市繁榮，故皆稱這里為黃家碼頭。
2021年10月，南京大學(xué)空間規(guī)劃研究中心、阿里研究院聯(lián)合發(fā)布2021年淘寶鎮(zhèn)名單，黃碼鎮(zhèn)榜上有名。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘寶鎮(zhèn)，黃碼鎮(zhèn)榜上有名。
2018年3月，江蘇省環(huán)保廳公布黃碼鎮(zhèn)為首批江蘇省生態(tài)文明建設(shè)示范鎮(zhèn)村。
2014年7月，農(nóng)業(yè)部認(rèn)定黃碼鎮(zhèn)為第四批全國一村一品示范村鎮(zhèn)（淮安紅椒）。
2012年12月，環(huán)境保護(hù)部授予黃碼鎮(zhèn)2010—2011年度國家級生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號。
淮陰市清浦區(qū)轄鄉(xiāng)。1953年建黃碼鄉(xiāng)，1958年改公社，1983年復(fù)置鄉(xiāng)，原屬淮安縣，1983年劃歸清浦區(qū)。位于市境南部，距市城區(qū)中心17公里。面積87平方公里，人口4.2萬。寧連一級公路從中部穿過，東鄰大運河。轄運西、運南、文渠、王李、許莊、合意、吳圩、李集、周圩、新河、嚴(yán)卓、周陳、周高、金左、三節(jié)跳、邱莊、港心、黃碼18個村委會。農(nóng)業(yè)以種植業(yè)為主，主產(chǎn)蔬菜。工業(yè)以鹽化為主。
歷史沿革：
1912年到1949年屬淮安縣，后屬鹽北區(qū)。
1958年成立黃碼公社包括鹽河，黃碼和運河三個公社，1962年劃出鹽河、運河二公社，1983年改置黃碼鄉(xiāng)，并由楚州區(qū)劃歸清浦區(qū)。
2018年12月1日，省政府正式批復(fù)撤銷鹽河鎮(zhèn)、黃碼鄉(xiāng)，設(shè)立新的黃碼鎮(zhèn)，沿用至今。