地名由來(lái)：因初此處有一家驛站，送信的人在此處換馬，故得名馬店，又因周邊名為馬店的集市較多，且朱姓居民較多，為與其他集市區(qū)分，加了一個(gè)朱，故得名朱馬店。
2022年12月，安徽省委農(nóng)村工作領(lǐng)導(dǎo)小組公布安徽省鄉(xiāng)村振興示范鎮(zhèn)創(chuàng)建名單，朱馬店鎮(zhèn)上榜。
2022年2月，安徽省愛(ài)國(guó)衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)委員會(huì)命名朱馬店鎮(zhèn)為2021年度安徽省衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（街道）。
2020年4月，朱馬店鎮(zhèn)上榜第五屆安徽省文明村鎮(zhèn)名錄。
朱馬店鎮(zhèn)是全省６３家建制中心鎮(zhèn)之一，土地６８．８平方公里，耕地５.４７萬(wàn)畝，人口超過(guò)４萬(wàn)，全鎮(zhèn)轄１５個(gè)行政村，１１０個(gè)自然莊。近年來(lái)，朱馬店鎮(zhèn)加快小城鎮(zhèn)建設(shè)步伐，構(gòu)建了縱橫交織的城鎮(zhèn)框架，其專(zhuān)業(yè)市場(chǎng)輻射周邊鄉(xiāng)鎮(zhèn)，帶動(dòng)了一方經(jīng)濟(jì)發(fā)展。朱馬店鎮(zhèn)還立足鎮(zhèn)情，抓傳統(tǒng)特色產(chǎn)業(yè)，其“羊肉湯”、響譽(yù)全國(guó)，并由此形成了１０萬(wàn)只山羊養(yǎng)殖基地。在種植業(yè)上，朱馬店鎮(zhèn)在全省率先打造糯米綠色品牌，制定農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)規(guī)程，規(guī)模生產(chǎn)無(wú)公害糯稻?！榜R店羊肉”、“銀鳳”糯米作為二塊叩響世界農(nóng)產(chǎn)品市場(chǎng)的敲門(mén)磚，為朱馬店鎮(zhèn)經(jīng)濟(jì)騰飛插上了有力的雙翅。相信，這顆鑲嵌在州來(lái)大地上的明珠在新時(shí)期一定會(huì)折射出更加璀璨的光芒！.
歷史沿革：
1949年成立馬店鄉(xiāng)。
1958年成立馬店人民公社，隸屬縣。
1961年9月屬馬店區(qū)。
1969年4月直屬縣。
1983年設(shè)區(qū)劃鄉(xiāng)，設(shè)馬店區(qū)馬店鄉(xiāng)。
1992年撤區(qū)并鄉(xiāng)，馬店鄉(xiāng)和肖集鄉(xiāng)合并成立朱馬店鎮(zhèn)，并沿用至今。