地名由來：因地處長江分岔的小河口上而得名。1974年10月，石首市撤區(qū)并社，永合公社（永合垸）、小河公社（張智垸）從調(diào)關(guān)區(qū)分離出來，河口公社（六合垸）從東升區(qū)分離出來，組成新的小河公社。1983年底，設(shè)小河口區(qū)，1987年，更名為小河口鎮(zhèn)。1999年3月，轄區(qū)內(nèi)的河口、天鵝、沙口、千字頭等4個(gè)村成建制劃給天鵝洲經(jīng)濟(jì)開發(fā)區(qū)。
2023年1月，小河口鎮(zhèn)被授予2022年湖北省森林城鎮(zhèn)稱號。
2021年2月，湖北省環(huán)境保護(hù)委員會(huì)命名小河口鎮(zhèn)為2020年度湖北省省級生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。
2020年7月，全國愛衛(wèi)會(huì)命名小河口鎮(zhèn)為2017-2019周期國家衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（縣城）。
2009年1月，小河口鎮(zhèn)上榜第二屆全國文明村鎮(zhèn)名單。
2005年10月，小河口鎮(zhèn)上榜第一屆全國文明村鎮(zhèn)名單。
石首市轄鎮(zhèn)。1986年經(jīng)前設(shè)小口公社，1986年撤縣建市設(shè)小河口鎮(zhèn)。位于市境東北部，距市區(qū)22.1公里。面積188.8平方公里，人口3.9萬。南瀕長江、北通監(jiān)利。轄中洲、永合閘、神皇廟、新河、黑瓦屋、畢家鋪、天心洲、鄭家臺、季家咀、半頭嶺、黃沙咀、楊苗洲、河溝子、合興、南河口、新江、南河洲、楊波坦、老洲嶺、小河口、河口、沙口、天鵝、千字頭24個(gè)村委會(huì)和小河口居委會(huì)。長江迂回流經(jīng)此地，大片長江故道成為農(nóng)牧、旅游開發(fā)地。主產(chǎn)糧食、棉花、油料。鄉(xiāng)鎮(zhèn)企業(yè)以服裝、糧棉油加工為主。.
歷史沿革：
清末，全縣劃分為4鄉(xiāng)，屬東鄉(xiāng)；1912年，全縣調(diào)整為9區(qū)，永合垸屬東2區(qū)，張智垸屬北2區(qū)；1926年，全縣劃為9區(qū)2市，所轄永合垸屬來市區(qū)，所轄張智垸屬橫溝市區(qū)；1932年，全縣設(shè)5區(qū)，屬調(diào)關(guān)區(qū)；1935年，全縣由5區(qū)調(diào)整為3區(qū)，屬調(diào)關(guān)區(qū)；1945年，全縣編為20個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，永合垸屬守望鄉(xiāng)（來市），張智垸屬小河鄉(xiāng)；1948年，全縣設(shè)20個(gè)鄉(xiāng)，屬小河鄉(xiāng)。
1951年，全縣改為9區(qū)1鎮(zhèn)，永合垸屬第三區(qū)（調(diào)弦），張智垸屬第8區(qū)（新廠）；1957年，全縣設(shè)3區(qū)，另縣直轄6鄉(xiāng)2鎮(zhèn)，永合垸屬調(diào)關(guān)區(qū)，張智垸屬江北區(qū)。
；1958年，全縣設(shè)6社，1個(gè)縣國營農(nóng)場，所轄永合垸屬桃花公社，所轄張智垸屬人民大垸公社；1961年，全縣改為5區(qū)2鎮(zhèn)，屬調(diào)關(guān)區(qū)；1974年，全縣撤區(qū)并社，將全縣45個(gè)公社并為11個(gè)大公社，1個(gè)縣轄社，縣國營良種場未變。
設(shè)立小河公社，轄小河、南河、河口、永合4個(gè)管理區(qū)；1984年，全縣撤社建區(qū)設(shè)鄉(xiāng)，設(shè)小河口區(qū)，轄永合垸鄉(xiāng)、張智垸鄉(xiāng)、河口鄉(xiāng)和小河口鎮(zhèn)；1987年，區(qū)、鄉(xiāng)體制改革后，更名為小河口鎮(zhèn)至今；1999年，轄區(qū)內(nèi)河口、天鵝、沙口、千字頭等4個(gè)村成建制劃歸天鵝洲經(jīng)濟(jì)開發(fā)區(qū)。