地名由來：尼山，古名尼丘山。因孔子生于此，又名丘，后世為避圣諱，改名為尼山。
2023年1月，尼山鎮(zhèn)被命名為2022年度山東省精品文旅名鎮(zhèn)（鄉(xiāng)村旅游重點(diǎn)鎮(zhèn)）。
2021年10月，尼山鎮(zhèn)被確定為山東省旅游民宿集聚區(qū)創(chuàng)建單位。
2020年3月，尼山鎮(zhèn)入選2019年度山東省省級(jí)耕地保護(hù)激勵(lì)鄉(xiāng)（鎮(zhèn)、街道）。
2019年12月，尼山鎮(zhèn)被認(rèn)定為第一批山東省鄉(xiāng)村振興示范鄉(xiāng)（鎮(zhèn)、街）。
2017年8月，尼山鎮(zhèn)被國(guó)家住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部認(rèn)定為第二批全國(guó)特色小鎮(zhèn)。
2014年9月，環(huán)境保護(hù)部授予尼山鎮(zhèn)2012年—2013年度國(guó)家級(jí)生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號(hào)。
2013年8月，尼山鎮(zhèn)獲評(píng)第三批山東省歷史文化名鎮(zhèn)名村。
南辛鎮(zhèn)是中國(guó)古代偉大的思想家、教育家、政治家、儒家學(xué)派的創(chuàng)始人孔子的誕生地，是2000年12月因鄉(xiāng)鎮(zhèn)規(guī)模調(diào)整由原尼山鄉(xiāng)、原南辛鎮(zhèn)合并組成的新鄉(xiāng)鎮(zhèn)。合并后的南辛鎮(zhèn)位于曲阜市東南部，西距曲阜市區(qū)15公里，南、東接鄒城市，東北鄰泗水縣，為三縣市交界處的政治、經(jīng)濟(jì)、文化重鎮(zhèn)。全鎮(zhèn)總面積101平方公里，總耕地面積6.4萬畝，轄6個(gè)管理片，42個(gè)行政村，總?cè)丝?.3萬人。
南辛鎮(zhèn)南、北、東三面環(huán)山，中西部為平原，地勢(shì)東高西低，南高北洼。主要有尼山、昌平山、四基山、盤龍山、柴山等,境內(nèi)有沂河、響河、洪河、蓼河4條主要河流。土壤土層厚，粘性大，水位深，且大部分為蒙金土壤，不粘不散，抗旱耐澇，保肥保水，宜耕性好，水利設(shè)施齊全，宜于瓜果、蔬菜等多種作物種植。境內(nèi)有日東高速公路、曲尼公路、張土公路等三條主要道路,交通便利，建有電視差轉(zhuǎn)臺(tái)和2個(gè)35千伏變電所。通訊設(shè)施齊全,有郵政和電信支局，建有程控電話交換機(jī)和全球通移動(dòng)電話中轉(zhuǎn)發(fā)射塔?？平涛幕l(wèi)生機(jī)構(gòu)齊全，建有市人民醫(yī)院南辛分院，有3處中學(xué),21處小學(xué)。
南辛鎮(zhèn)河沙、礦石資源豐富,辛莊村礦山可生產(chǎn)700號(hào)高標(biāo)號(hào)水泥,儲(chǔ)量1億立方米。官莊村產(chǎn)優(yōu)質(zhì)天然礦泉水，年開采量50萬噸，已通過國(guó)家地質(zhì)礦產(chǎn)部批準(zhǔn)生產(chǎn)，并以地環(huán)礦水發(fā)[1994]205號(hào)文公布。特產(chǎn)主要有彭莊石榴、日本大蔥、羅非魚、尼山硯等?，F(xiàn)正于尼山風(fēng)景區(qū)開發(fā)建設(shè)中國(guó)圣水城。境內(nèi)生態(tài)環(huán)境良好，碧水清山，尼山水庫(kù)總蓄水能力1.2億立方米,是曲阜市兗州市地表水和地下水的主要來源。南辛鎮(zhèn)是休閑旅游、投資興業(yè)、生產(chǎn)綠色食品的理想之地。
四基山觀音廟
四基山觀音廟，位于曲阜市尼山鎮(zhèn)大煙莊村南四基山上，始建于明代。清代多次進(jìn)行維修，廟在山套內(nèi)，東、西、南三面環(huán)山，北面為山口，由此進(jìn)山往南約500米處，即是廟院。廟院靠西山根，坐北面南，前后三
尼山水庫(kù)水利設(shè)施
尼山水庫(kù)水利設(shè)施（1）位置：曲阜市尼山鎮(zhèn)劉家樓村。（2）保護(hù)范圍：以壩體為中心（大壩中心：北緯35°29′30.5″，東經(jīng)117°11′46.5″），向東30米，向西20米，向南、北各1
曲阜白村遺址
白村遺址（1）位置：曲阜市尼山鎮(zhèn)西白村。（2）保護(hù)范圍：以坐標(biāo)點(diǎn)（35°30’40.60，117°09’26.9）為基點(diǎn)向東、西各180米，向南北各100米。（3）建設(shè)控制地帶：保護(hù)范圍外1
“五四”青年洞
“五四”青年洞（1）位置：曲阜市尼山鎮(zhèn)黃土村胡家山。（2）保護(hù)范圍：南、北洞口外各30米。（3）建設(shè)控制地帶：按特殊控制地帶控制管理，保持山體的自然風(fēng)貌。
迎坤橋
迎坤橋（1）位置：曲阜市尼山鎮(zhèn)桑莊村。（2）保護(hù)范圍：橋周圍5米以內(nèi)。（3）建設(shè)控制地帶：保護(hù)范圍外50米。
歷史沿革：
建國(guó)前，鎮(zhèn)內(nèi)村莊除屯里、大胡村東西大街以北屬曲阜外，其余皆歸屬鄒縣管轄。
南部村莊屬土旺社，北部屬大胡社，東部屬魯源社。
民國(guó)時(shí)期為鄒縣二區(qū)。
1945年12月劃歸曲阜第五區(qū)。
1946年4月，曲泗縣第五區(qū)公所改稱曲阜縣第五區(qū)公所，機(jī)關(guān)駐南辛村。
1948年7月，鄒縣南辛區(qū)劃歸曲阜縣。
1949年為南辛區(qū)，下設(shè)13個(gè)鄉(xiāng)。
1950年8月，南辛區(qū)委改稱第五區(qū)委。
1955年5月又改為南辛區(qū)委。
區(qū)委駐南辛村。
1956年8月，南辛區(qū)下設(shè)南辛、魏莊、夏宋、息陬4個(gè)鄉(xiāng)。
1958年9月成立南辛人民公社。
原南辛區(qū)及所轄的南辛、魏莊鄉(xiāng)撤銷。
1965年8月，人民公社體制調(diào)整，原南辛人民公社改稱南辛區(qū)。
下設(shè)南辛、余村、魯源、曼山、魏莊5個(gè)公社。
1968年，區(qū)改為公社，原5個(gè)公社改稱生產(chǎn)管理區(qū)。
1970年成立尼山公社，1984年5月公社改區(qū)，南辛區(qū)轄南辛鎮(zhèn)、尼山鄉(xiāng)、曼山鄉(xiāng)。
1985年10月尼山鄉(xiāng)從南辛區(qū)劃出，列為縣直屬鄉(xiāng)，轄3個(gè)管理片、19個(gè)行政村。
1986年6月撤縣改市，南辛區(qū)改稱鎮(zhèn)，轄3個(gè)管理片、23個(gè)行政村。
2000年12月，鄉(xiāng)鎮(zhèn)規(guī)模調(diào)整，原尼山鄉(xiāng)、原南辛鎮(zhèn)合并組成新的南辛鎮(zhèn)，轄南辛、曼山、余村、庫(kù)西、庫(kù)南、庫(kù)北6個(gè)管理片，42個(gè)行政村。
2011年5月18日，經(jīng)山東省人民政府（魯政函民字〔2011〕18號(hào)文）批準(zhǔn)，將南辛鎮(zhèn)更名為尼山鎮(zhèn)至今。
2020年行政村建制優(yōu)化后轄29個(gè)村委會(huì)。