地名由來：明末有祖姓遷此建樓成村，并擁有周圍18個(gè)田莊，得名祖老樓，簡(jiǎn)稱今名。
2022年2月，安徽省愛國(guó)衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)委員會(huì)命名祖樓鎮(zhèn)為2021年度安徽省衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（街道）。
2022年1月，祖樓鎮(zhèn)被命名為2021年度安徽省森林城鎮(zhèn)。
蕭縣轄鎮(zhèn)。1949年為祖樓鄉(xiāng)，1958年成立公社，1980年改區(qū)，1992年祖樓、劉歇集、孫樓三個(gè)鄉(xiāng)合并建祖樓鎮(zhèn)。位于縣境西南部，距縣城24公里。面積53平方公里，人口4.1萬(wàn)。洪堿河流經(jīng)境內(nèi)，311國(guó)道過境。轄蔣莊、朱樓、祖樓、蘇集、柘園、荀樓、相山廟、魯莊、張灣、種莊、時(shí)莊、新莊、墓上、周土樓、劉歇集、天齊廟、申河、穆寨、孟蘇莊、迭路北、王石橋、甘樓、夏莊、孫樓、毛河涯、穆樓、板橋27年村委會(huì)。農(nóng)業(yè)為主，產(chǎn)小麥、玉米、山芋、花生、棉花、大豆等。
歷史沿革：
1949年設(shè)祖樓區(qū)祖樓鄉(xiāng)。
1958年建立祖樓公社。
1985年再置祖樓區(qū)。
1992年，撤區(qū)并鄉(xiāng)，祖樓、劉歇集、孫樓3個(gè)鄉(xiāng)合并設(shè)立祖樓鎮(zhèn)。