地名由來(lái)：蔡旗鎮(zhèn)因境內(nèi)有明代所置蔡旗堡而得名。
2019年1月，甘肅省愛國(guó)衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)委員會(huì)命名蔡旗鎮(zhèn)為2018年度甘肅省衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（街道）。
民勤縣轄鄉(xiāng)。1956年設(shè)蔡旗鄉(xiāng)，1958年改公社，1983年復(fù)置鄉(xiāng)。位于縣境西南部，距縣城53公里。面積66平方公里，人口0.9萬(wàn)。有公路與民(勤)武(威)公路相接。轄蔡旗、金家莊、麻家灣、野潴灣、小西溝、高廟、沙灘、月牙、官溝9個(gè)村委會(huì)。鄉(xiāng)鎮(zhèn)企業(yè)有運(yùn)輸、商貿(mào)等行業(yè)。農(nóng)業(yè)主產(chǎn)小麥、玉米、馬鈴薯。境內(nèi)有沙灘漢墓群。
歷史沿革：
兩漢、北朝北魏、西魏時(shí)期，蔡旗鎮(zhèn)境域?qū)傩?a href='http://www.cnsunnet.cn/xingtaiditu/xintaiweixian.html' target='_blank'>威縣。
北朝北周至隋時(shí)，屬姑臧縣。
唐時(shí)，屬明威府。
元時(shí)，屬永昌路。
明時(shí)，屬鎮(zhèn)番衛(wèi)。
清時(shí)，屬鎮(zhèn)番縣。
民國(guó)二十五年（1936年），屬第三區(qū)，為蔡旗堡聯(lián)保。
民國(guó)三十六年（1947年），劃屬環(huán)河鄉(xiāng)。
1949年10月，與重興鄉(xiāng)合并為環(huán)河區(qū)。
1956年1月，分為蔡旗鄉(xiāng)。
1958年10月，成立蔡旗公社。
1983年4月，改設(shè)蔡旗鄉(xiāng)。
2016年，撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)。