地名由來：磨憨為傣語地名，磨即鹽井，憨即富裕。磨憨意為富裕鹽井。
2021年3月，磨憨鎮(zhèn)入選2020年云南省衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)名單。
2016年12月，國家民委命名磨憨鎮(zhèn)為第四批全國民族團結進步創(chuàng)建活動示范單位。
2014年9月，環(huán)境保護部授予磨憨鎮(zhèn)2012年—2013年度國家級生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號。
磨憨鎮(zhèn)位于縣城東南部，地處北緯21度10分至21度26分，東經(jīng)101度27分至101度41分之間，東、南面與老撾交界，西面與勐滿鎮(zhèn)相連，北于勐臘鄉(xiāng)毗鄰，總面積803平方公里。鄉(xiāng)政府駐-村，距縣城50公里。轄6個村公所，49個自然村。當?shù)厥谰由贁?shù)民族主要有傣族、瑤族、哈尼族、苗族、拉祜族及克木人等。
磨憨鎮(zhèn)地勢多中低山峽谷，北高南低，溝谷縱橫。有森林面積859399畝，占總面積的百分之73.43，平均氣溫20攝氏度，年均降雨量在1000——1067.5毫米之間，鄉(xiāng)里平均海拔900米，最高點為董宗堡梁子，海拔1674米，最低點在曼莊寨河邊，海拔650米。主要河流有南哈河、南窩河和南西河。
以農(nóng)業(yè)為主，主產(chǎn)稻谷、包谷和黃豆，主要經(jīng)濟作物有橡膠、茶葉和南藥等。
歷史沿革：
明隆慶四年（1570年），劃12版納，尚勇屬勐臘勐棒版納。
清光緒三十二年（1896年），屬勐臘土把總。
民國元年（1912年），屬第五區(qū)。
民國十六年（1927年）8月，屬鎮(zhèn)越縣。
民國二十二年（1933年），屬第二區(qū)。
1953年1月23日，成立西雙版納自治區(qū)后，取消縣治，屬版納勐臘，尚勇是第七。
1969年5月，原尚勇區(qū)改為前哨公社。
1984年，復建區(qū)。
1988年2月，尚勇區(qū)勇鄉(xiāng)。
1997年2月，尚勇鄉(xiāng)與磨憨口岸合并為磨憨鎮(zhèn)。
2001年5月，根據(jù)省政府現(xiàn)場辦公會精神，磨憨邊境貿易區(qū)掛牌設立。
2006年9月，磨憨邊境貿易區(qū)更名為“云南西雙版納磨憨經(jīng)濟開發(fā)區(qū)”。
2011年6月29日，舉行尚勇鎮(zhèn)劃歸磨憨經(jīng)濟開發(fā)區(qū)簽字儀式，尚勇鎮(zhèn)正式劃歸磨憨經(jīng)濟開發(fā)區(qū)。
2016年8月31日，磨憨鎮(zhèn)正式恢復建制，劃歸勐臘縣管理。
2022年5月，磨憨鎮(zhèn)由昆明市托管。