地名由來(lái)：明弘治年間（1488—1505年）建村時(shí)，因地處河川，有一形似馬蹄的巨石而得名。
2014年7月，馬蹄溝鎮(zhèn)被國(guó)家住房城鄉(xiāng)建設(shè)部等七部委確定為全國(guó)重點(diǎn)鎮(zhèn)。
馬蹄溝鎮(zhèn)人民政府位于子洲縣城以西10公里處，307國(guó)道穿鎮(zhèn)而過(guò)，全鎮(zhèn)總面積103。4平方公里，轄40個(gè)行政村，總?cè)丝?5064人，交通便利，集貿(mào)市場(chǎng)繁榮。
近年來(lái)，鎮(zhèn)黨委、鎮(zhèn)政府堅(jiān)持以經(jīng)濟(jì)建設(shè)為中心，緊緊圍繞農(nóng)村產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整和科技興農(nóng)的戰(zhàn)略思路，使全鎮(zhèn)經(jīng)濟(jì)建設(shè)和社會(huì)各項(xiàng)事業(yè)全面發(fā)展。
一是發(fā)展“一村一品”，調(diào)整產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)。該鎮(zhèn)通過(guò)請(qǐng)專家到田間地頭解難題、印發(fā)技術(shù)資料、提供資金、幫助銷售等途徑，在26個(gè)村近3000戶農(nóng)民中推廣地膜洋芋800畝、黃豆400畝、西小瓜380畝、玉米2000多畝，產(chǎn)量、收入較推廣前翻一番。二是加強(qiáng)基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)。該鎮(zhèn)投入12萬(wàn)多元，修通長(zhǎng)3.4公里、寬5米的鄉(xiāng)村道路，解決了石灰峪、徐家溝等4個(gè)村2000多人的行路難問(wèn)題。抓住吳定高速公路建設(shè)的契機(jī)，多方做工作，投資80多萬(wàn)元修建兩座大橋，大大方便了周邊群眾出行。該鎮(zhèn)還投資20多萬(wàn)元，辦起使用面積150多平方米的“農(nóng)民實(shí)用技術(shù)培訓(xùn)學(xué)?！保桓鞔宥夹陆ɑ蚋脑旖ㄔO(shè)起黨員活動(dòng)室、計(jì)生服務(wù)站。針對(duì)鎮(zhèn)政府附近離退休干部多的實(shí)際，該鎮(zhèn)投入11萬(wàn)多元，在政府原辦公處改造建成260多平方米的“中老年活動(dòng)中心”。三是進(jìn)行市場(chǎng)建設(shè)。該鎮(zhèn)針對(duì)馬蹄溝舊市場(chǎng)老化、以路為市的問(wèn)題，投資15萬(wàn)元建設(shè)二道街市場(chǎng)。
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子洲西峰寺
子洲縣瓜園則灣鄉(xiāng)政府東北2公里處有一塊山地，名叫蘆草壇，其上有一西峰寺，依山而建。北臨乏牛山，西北與柏全山相望。蘆草壇雖不雄偉壯觀，卻也峻峭，人若站于其頂眺望，視野倒也開闊，更因其西峰寺而遐
子洲目連寺
乏牛山位于瓜園則灣鄉(xiāng)政府駐地東北3公里處，顧名思義，該山高峻挺拔，耕犁和行走于此山的老黃牛也會(huì)困乏。因其山巔設(shè)“目連寺”，當(dāng)?shù)厝罕娨喾Q之為目連山。據(jù)說(shuō)，上世紀(jì)60年代初，國(guó)家曾在目連寺旁搭過(guò)
子洲柏全山
柏全山位于瓜園則灣鄉(xiāng)政府駐地南3公里處。據(jù)傳說(shuō)，此山曾有4株枝葉繁茂的大柏樹，故名柏全山。柏全山北高南低，山巔上有一古廟，主奉天皇、地皇、人皇，簡(jiǎn)稱為“三皇廟”。坐北面南，正殿為三孔硬山形頂
陜甘寧邊區(qū)被服廠臨時(shí)駐地舊址
陜甘寧邊區(qū)被服廠臨時(shí)駐地舊址位于榆林市子洲縣馬蹄溝鎮(zhèn)吳家溝村。1947年6月，中共中央西北局和陜甘寧邊區(qū)政府機(jī)關(guān)從安塞白廟岔轉(zhuǎn)移到子洲縣馬蹄溝。同時(shí)轉(zhuǎn)移來(lái)的還有陜甘寧邊區(qū)被服廠，駐扎吳家溝村
陜甘寧邊區(qū)隨軍醫(yī)院臨時(shí)駐地舊址
陜甘寧邊區(qū)隨軍醫(yī)院臨時(shí)駐地舊址位于榆林市子洲縣馬蹄溝鎮(zhèn)清水溝村。1947年6月11日，中共中央西北局和陜甘寧邊區(qū)政府機(jī)關(guān)從安塞白廟岔轉(zhuǎn)移到子洲縣馬蹄溝。同來(lái)的還有陜甘寧邊區(qū)隨軍醫(yī)院，陜甘寧邊
歷史沿革：
建縣前屬橫山、米脂和綏德3縣。
民國(guó)三十三年（1944年），屬子洲縣馬蹄溝區(qū)。
1961年，復(fù)縣后仍為馬蹄溝公社。
1984年，改設(shè)為馬蹄溝鎮(zhèn)，轄5個(gè)社區(qū)，37個(gè)行政村。
2001年，三眼泉鄉(xiāng)并入馬蹄溝鎮(zhèn)。
2011年，馬蹄溝鎮(zhèn)瓜園則灣鄉(xiāng)并入馬蹄溝鎮(zhèn)。