地名由來：清光緒《定海鄉(xiāng)土教材》載：“陳錢之西為里西，俗呼虬嶼?！彬皫Z，蓋因島形蟠曲得名。嶼，在舟山方言音稱為“qi”，故由“虬嶼”諧音歧化成“枸杞”?！吨凵胶Ｓ驆u礁志》載“島以枸杞岙附近遍長可供中藥用的枸杞得名”，疑有望文生義之嫌。
2023年1月，枸杞鄉(xiāng)被納入2022年浙江省鄉(xiāng)村振興示范鄉(xiāng)鎮(zhèn)創(chuàng)建名單。
2021年5月，枸杞鄉(xiāng)被列入2021年度浙江省美麗城鎮(zhèn)建設(shè)樣板創(chuàng)建名單（農(nóng)業(yè)特色型）。
2021年4月，枸杞鄉(xiāng)入選農(nóng)業(yè)農(nóng)村部、財(cái)政部2021年農(nóng)業(yè)強(qiáng)鎮(zhèn)創(chuàng)建名單。
2011年10月，環(huán)境保護(hù)部授予枸杞鄉(xiāng)2011年國家生態(tài)建設(shè)示范區(qū)之“全國環(huán)境優(yōu)美鄉(xiāng)鎮(zhèn)”稱號。
2011年8月，農(nóng)業(yè)部認(rèn)定枸杞鄉(xiāng)為第一批全國一村一品示范村鎮(zhèn)（貽貝）。
嵊泗縣轄鄉(xiāng)。1934年建枸杞鄉(xiāng)，1962年改公社，1984年復(fù)置鄉(xiāng)。位于縣境東部，有枸杞島等大小島嶼33個(gè)。陸地面積共5.9平方公里，其中枸杞島5.6平方公里，人口1萬。屬海島丘陵，中部地勢平緩，谷地開闊。轄有大王、石浦、勝利、枸杞、烏沙、廟干、干斜、里西等8個(gè)村委會(huì)。主要從事漁業(yè)生產(chǎn)，主要養(yǎng)殖貽貝、鮑魚、牡蠣、裙帶菜、海帶、羊棲紫、石斑魚等，并建有貽貝、鮑魚育苗場。有水產(chǎn)冷凍廠。為著名游覽地。有“山海奇觀”摩崖石刻，系明萬歷十八年(1590)都督侯繼高防倭巡海至此所題。另有金沙碧海、奇巖怪洞、古代廟宇等眾多景點(diǎn)。
山海奇觀摩崖題記
山海奇觀摩崖題記位于嵊泗縣枸杞鄉(xiāng)，年代為明?！吧胶Ｆ嬗^”石刻位于嵊泗縣枸杞島上，高9米，寬8米的巨石上鐫刻“山海奇觀”四個(gè)大字，系明萬歷十八年（1589年）都督侯繼高巡訊至此，登高遠(yuǎn)眺，觸景
歷史沿革：
古稱干斜、里西。
元代為蓬萊鄉(xiāng)69岙之一，大德《昌國州圖志》卷二以“干斜”岙名記載。
明天啟《海鹽縣圖經(jīng)》載為“里西”。
明嘉靖《籌海圖編》卷一載為“李西岙”。
清康熙《定?？h志》卷五載為“李西山”。
干斜、里西之名，均以島上的干斜、里西岙得名。
清光緒《江蘇沿海圖說》載為“枸杞山”。
1934年，置枸杞鄉(xiāng)。
1950年起屬嵊泗特區(qū)（縣）。
1958年改為嵊泗人民公社枸杞生產(chǎn)大隊(duì)。
1962年改為公社。
1984年復(fù)設(shè)鄉(xiāng)。
名稱一直沿用至今。