地名由來：北宋建隆元年（960），村南挖了一條運糧河（趙王河），該村設(shè)有碼頭并形成集市，故改村名為碼頭集，習(xí)寫馬頭集。鎮(zhèn)政府駐地馬頭集村，而得名馬頭鎮(zhèn)。
2022年4月，馬頭鎮(zhèn)被確定為第三批山東省鄉(xiāng)村振興“十百千”示范創(chuàng)建鄉(xiāng)（鎮(zhèn)、街）。
2020年12月，山東省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳公布2020年山東省農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)強鎮(zhèn)名單，馬頭鎮(zhèn)榜上有名。
2019年7月，馬頭鎮(zhèn)入選2019年全國農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)強鎮(zhèn)建設(shè)名單。
東明縣轄鎮(zhèn)。全國聞名的西瓜之鄉(xiāng)。1958年設(shè)馬頭公社管理區(qū)，1984年改馬頭鄉(xiāng)，1994年設(shè)鎮(zhèn)。位于縣城南，距縣城31公里。面積84.7平方公里，人口3.1萬。轄馬坊、靳莊、李龍莊、邵莊、柳園、牛皮店、馬廠、新莊、李莊、關(guān)莊、南街、西街、西門、盛店、北街、東街、權(quán)東寺、夾堤王、柳林、王祥占、王頭、李唐橋、王街、趙街、姚村、李六屯、小康寺、梁坊、蘇占、陳占、小屯、安本屯、郭屯、鮑夫莊、祥付營、豆占、解莊、牛八屯38個村委會。農(nóng)業(yè)以花生、西瓜、棉花為主。工業(yè)產(chǎn)品主要有毛板、抱花板、鬃毛與電子設(shè)備。
東寺孫氏家族墓
東寺孫氏家族墓位于東明縣馬頭鎮(zhèn)。年代為明。2013年，東寺孫氏家族墓被山東省人民政府公布為山東省第四批省級文物保護單位。
歷史沿革：
該村隋唐時為冤句舊地；金哀宗天興元年（1232）析東明南六鄉(xiāng)（含該村）為蘭陽縣；明清時期，屬直隸東明縣。
其四關(guān)（該村南關(guān)、西關(guān)及盛店、北關(guān)及之賈莊，東關(guān)之權(quán)莊）由河南祥符、河北長垣和河南陳留分轄；1911年屬東明第五鄉(xiāng)；1933屬東明縣六區(qū)；1948年屬東明縣第五區(qū)。
1958成立馬頭公社。
1961年成立馬頭區(qū)，1963年撤區(qū)恢復(fù)馬頭公社。
1984年設(shè)立馬頭鄉(xiāng)，1996年撤銷馬頭鄉(xiāng)設(shè)立馬頭鎮(zhèn)人民政府至今。