地名由來：明朝時期有飛來之磨，落于該地，恰巧有一伙強盜在此分贓，頭被此磨砸得粉碎，而得名“磨頭”。1985年經(jīng)江蘇省人民政府批準(zhǔn)撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)。
2021年10月，南京大學(xué)空間規(guī)劃研究中心、阿里研究院聯(lián)合發(fā)布2021年淘寶鎮(zhèn)名單，磨頭鎮(zhèn)榜上有名。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘寶鎮(zhèn)，磨頭鎮(zhèn)榜上有名。
2020年7月，全國愛國衛(wèi)生運動委員會重新確認(rèn)磨頭鎮(zhèn)為2020年國家衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（縣城）。
2018年3月，江蘇省環(huán)保廳公布磨頭鎮(zhèn)為首批江蘇省生態(tài)文明建設(shè)示范鎮(zhèn)村。
2011年10月，環(huán)境保護部授予磨頭鎮(zhèn)2011年國家生態(tài)建設(shè)示范區(qū)之“全國環(huán)境優(yōu)美鄉(xiāng)鎮(zhèn)”稱號。
如皋市轄鎮(zhèn)。1949年設(shè)磨頭鄉(xiāng)，1957年由仁靜、磨頭、徐石3鄉(xiāng)一部分并為磨頭鄉(xiāng)，1958年改公社，1983年復(fù)鄉(xiāng)，1986年建鎮(zhèn)。位于市境中部，距市府12公里。面積37.1平方公里，人口3.3萬。如海運河、丁磨公路、204國道過境。轄磨北、天陽、吳曹、丁郭、東冒、西冒、肖石、范蕩、曹田、董堡、南屋、鄧莊、星一、嚴(yán)堡、大狄、八角、趙港、星光、磨南、小磨、宋渡、王戶、小狄23個村委會。農(nóng)業(yè)主產(chǎn)玉米、小麥、花生、山芋、豆類。特產(chǎn)胡蘿卜、東串豬。企業(yè)有巢絲、農(nóng)具、機械、繡花等。鎮(zhèn)區(qū)東側(cè)有蘇中皋南戰(zhàn)斗烈士陵園。是明書法家賈鳴鳳、近代老同盟會會員沈卓吾的出生地。
歷史沿革：
清光緒年間因人口達(dá)四萬以上而稱磨頭市；民國時為如皋市第十一區(qū)；1946年為如皋市第九區(qū)，1949年改稱磨頭區(qū)，1958年成立磨頭人民公社；1983年改為磨頭鄉(xiāng)；1985年撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。
2001年10月6日，依皋政發(fā)〔2001〕235號文件，將磨頭鎮(zhèn)與場北鄉(xiāng)合并，設(shè)立新的磨頭鎮(zhèn)沿用至今。