地名由來：明代時(shí)處于滄海之中，名“浪白”，與連灣山對峙，自成一港，從打銀咀到雞心洲中間海峽，東西相通，船舶南北可泊，為當(dāng)時(shí)著名的天然良港“浪白澳”（“澳”即港口）。“浪白澳”之南稱南水，之北稱北水。清光緒四年（1878年），浪白因漁貨交易興旺而被立為“南水墟”，“南水”從此定名。
2023年4月，2022年廣東省鄉(xiāng)村治理示范鎮(zhèn)名單出爐，南水鎮(zhèn)在列。
2021年10月，南水鎮(zhèn)上榜2021年全國千強(qiáng)鎮(zhèn)名單，排名第42位。
2020年7月，全國愛國衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)委員會(huì)重新確認(rèn)南水鎮(zhèn)為2020年國家衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)（縣城）。
2019年10月，2019年度全國綜合實(shí)力千強(qiáng)鎮(zhèn)榜單公布，南水鎮(zhèn)位列第221名。
2012年12月，環(huán)境保護(hù)部授予南水鎮(zhèn)2010—2011年度國家級(jí)生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號(hào)。
1957年設(shè)南水鄉(xiāng)，屬中山縣。1961年改南水公社，屬珠海縣。1979年珠海設(shè)市，劃屬香洲區(qū)，1986年建鎮(zhèn)。位于市境西南部，由南水半島和高欄、荷包等10多個(gè)島嶼組成，陸地面積84平方公里，人口0.8萬。鎮(zhèn)中心距市城區(qū)中心40公里、珠海港口9公里、珠海機(jī)場20多公里，水路距香港45公里、澳門15公里。市區(qū)至港口的高速公路直達(dá)鎮(zhèn)南，珠海國際深水港位于轄區(qū)內(nèi)。轄南水、海安、南郊、南場、金龍、高欄、沙白石、鐵爐、飛沙、荷苞10個(gè)村委會(huì)。以農(nóng)、漁業(yè)為主，產(chǎn)品有稻谷、蝦、蟹、魚等。建有1個(gè)墟鎮(zhèn)。境內(nèi)發(fā)現(xiàn)的具有3000多年文化歷史的摩崖石刻畫是廣東省重點(diǎn)保護(hù)文物。
歷史沿革：
北宋以前，南水屬于新會(huì)縣。
南宋紹興二十二年（1152年），劃歸東莞縣的香山寨，后設(shè)立香山縣（今中山市），屬香山縣黃梁都，隸屬于廣州府。
明嘉靖八年（1529年），廣州府香山縣在浪白設(shè)置市舶，屬廣州市舶司管轄，為明朝主要通商口岸之一。
民國十四年（1925年），香山縣改為中山縣，南水（包括北水、連灣）是中山縣第七區(qū)（三灶區(qū)）的一個(gè)鄉(xiāng)。
1953年，珠海從中山縣劃出，成為珠海縣，南水是珠海縣第三區(qū)（三灶區(qū)）的一個(gè)鄉(xiāng)。
1958年，珠?？h再度和中山縣合并，成立三灶公社，南水為三灶公社的一個(gè)鄉(xiāng)，高欄定為中山縣地方國營鹽場。
1961年，恢復(fù)珠?？h，南水仍為三灶公社的一個(gè)鄉(xiāng)，但連灣、北水從闡水劃出，連灣劃歸平沙農(nóng)場，北水被立為北水蠔場，直屬廣東省水產(chǎn)廳管轄。
1962年，南水從三灶劃出，成立南水公社，管轄1條街道、17個(gè)村莊、18個(gè)海島。
1979年3月5日，珠?？h改為珠海市，南水為珠海市的一個(gè)公任。
1982年6月，南水公社改制為南水區(qū)公所。
1984年8月，珠海市設(shè)立縣級(jí)建制的香洲區(qū)，南水屬香洲區(qū)的一個(gè)區(qū)公所。
1987年4月，南水撤區(qū)建鎮(zhèn)為香洲區(qū)南水鎮(zhèn)。
1988年12月12日，珠海市設(shè)立行使縣級(jí)權(quán)限的三灶管理區(qū)，南水鎮(zhèn)、三灶鎮(zhèn)及小林鎮(zhèn)劃歸三灶管理區(qū)。
1993年，劃歸珠海港管理區(qū)管理。
1994年4月，南水鎮(zhèn)從二社區(qū)獨(dú)社孫分和國港管理區(qū)管轄。
1999年12月，南水被國務(wù)院體改辦列為國家級(jí)小城鎮(zhèn)綜合改革試點(diǎn)鎮(zhèn)，行使部分縣級(jí)經(jīng)濟(jì)管理權(quán)限。
2001年4月4日，珠海市成立金灣區(qū)，南水、三灶、小林、平沙和紅旗5個(gè)鎮(zhèn)及金海岸街道劃歸金灣區(qū)管轄。
2006年7月3日，珠海臨港工業(yè)區(qū)和南水鎮(zhèn)實(shí)施“區(qū)鎮(zhèn)合一”體制改革新模式，正式成立珠海高欄港經(jīng)濟(jì)區(qū)。