地名由來：1937年璦琿縣南境析置孫吳縣，以孫、吳兩家地營(yíng)子得名，據(jù)說在很久以前有孫吳二姓居住于此，故名。
2022年2月，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部辦公廳認(rèn)定孫吳縣為國(guó)家級(jí)制種大縣（大豆）。
2021年6月，孫吳縣上榜2021年農(nóng)產(chǎn)品電商百?gòu)?qiáng)縣名單，代表農(nóng)產(chǎn)品為水果(沙棘)、豆制品。
2021年5月，根據(jù)第七次全國(guó)人口普查結(jié)果，孫吳縣人口數(shù)量為7.34萬人，位列黑河市各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第6位，位列黑龍江各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第101位，位列全國(guó)各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第2656位。
2020年12月，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部辦公廳認(rèn)定孫吳縣為全國(guó)第五批率先基本實(shí)現(xiàn)主要農(nóng)作物生產(chǎn)全程機(jī)械化示范縣（市、區(qū)）。
2018年2月，孫吳縣上榜2017年全國(guó)義務(wù)教育發(fā)展基本均衡縣（市、區(qū)）名單。
孫吳縣地處黑龍江省北部、小興安嶺北麓、黑河市中部，北鄰黑河市，南接五大連池市，西連嫩江縣，東與遜克縣毗鄰，是黑河市的重要交通樞紐。邊境線長(zhǎng)35公里，與俄羅斯阿穆爾州的康斯坦丁諾夫卡區(qū)隔黑龍江相望。全縣總面積4318.9平方公里，轄2鎮(zhèn)9鄉(xiāng)（含1個(gè)民族鄉(xiāng)）、94個(gè)行政村，2個(gè)國(guó)營(yíng)農(nóng)牧場(chǎng)、7個(gè)國(guó)有林場(chǎng)。
孫吳縣位于東經(jīng)126°40′—128°，北緯48°59′—49°42′，屬寒溫帶大陸性季風(fēng)氣候，橫跨四、五、六三個(gè)積溫帶，年平均氣溫為-0.6℃，平均日照2551.5小時(shí)，平均降雨量400—650毫米，平均降雪期為215天，有效積溫在1800℃—2200℃之間，無霜期為80—120天，大于等于5級(jí)風(fēng)平均日數(shù)為103.1天，風(fēng)能資源豐富。孫吳鐵路、公路、水運(yùn)交通網(wǎng)絡(luò)縱橫交錯(cuò)，哈黑鐵路、202國(guó)道縱貫全境，縣城北距黑河口岸飛機(jī)場(chǎng)、東臨遜克口岸均百余里，是黑河地區(qū)大宗商業(yè)物資的重要中轉(zhuǎn)地。孫吳縣外向型經(jīng)濟(jì)發(fā)展?jié)摿^大，擁有對(duì)外開放的國(guó)家一類水運(yùn)口岸，沿黑龍江上行可達(dá)黑河、漠河等邊境市縣，下行可達(dá)佳木斯、哈爾濱等大中城市，沿黑龍江入海口可通往太平洋沿岸各大港口，具有發(fā)展江海聯(lián)運(yùn)的后發(fā)優(yōu)勢(shì)。近年來，先后與俄羅斯的布拉戈維申斯克、潔雅、希馬諾夫斯克等城市建立了友好關(guān)系，對(duì)俄經(jīng)貿(mào)活動(dòng)日益廣泛。
孫吳縣歷史悠久。早在唐朝時(shí)期，隸屬室韋都護(hù)府管轄；金代屬蒲與路管轄；元朝初期，屬乃顏封地，后屬開元路矢寶赤萬戶府管轄；明朝時(shí)期，為奴兒干都司所轄；清代順治元年歸盛京總管統(tǒng)轄，后為寧古塔昂邦章京所轄；康熙24年至38年屬黑龍江將軍所轄下的瑗琿副都統(tǒng)所轄；宣統(tǒng)元年屬璦琿兵備道；民國(guó)元年，屬璦琿直隸廳所轄；1913年3月至1937年9月，歸屬璦琿縣。偽滿康德4年（即：1937年）12月1日成立偽孫吳縣公署，隸屬偽黑河??；1945年11月建立紅色政權(quán)，歸屬黑河地區(qū)所轄。1977年4月，孫吳將奮斗公社所轄六連、八連（今靠山村）和十二連（今河西村）、茅欄河以東地域劃歸遜克縣；1979年3月至4月，孫吳與五大連池市（原德都縣）、嫩江縣分別明確了邊界。
歷史沿革：
唐屬室韋都護(hù)府。
金屬蒲與路。
元屬乃顏封地，后屬開元路矢寶赤萬戶府。
明屬努爾干都指揮使司。
清順治十年（1653），屬寧古塔昂幫章京。
康熙二十二年，（1683）屬黑龍江將軍治下璦琿副都統(tǒng)。
宣統(tǒng)元年（1909年），屬璦琿兵備道。
1913年，屬璦琿縣第八區(qū)。
1937年12月，設(shè)孫吳縣，隸屬黑河省。
1940年，將今二道河以東劃入。
1945年12月，設(shè)孫吳縣。
名稱沿用至今。