行政隸屬清時屬詔安縣五都三圖康羅保南山村；民國時屬東山縣中興鎮(zhèn)南港保（南山和西港村合）；建國后屬三區(qū)南湖鄉(xiāng)（與下湖、嶺下合）；1951年屬樟塘公社南湖鄉(xiāng)；1959年屬康美公社南湖大隊；1961年拆出獨立成樟塘公社南山大隊；1984年屬樟塘鄉(xiāng)南山村；1993年屬樟塘鎮(zhèn)南山村。
面積人口全村面積1.1平方公里，耕地面積377畝，山林面積98畝。300戶，人口1164人，6個村民小組，黨員42人（正式黨員41人，預(yù)備黨員1人）。目前，隨著縣城東擴(kuò)，該村大量土地已被征用，剩余土地不足200畝，全村已失地的農(nóng)民達(dá)到700多人,約占全村人口的三分之二。
位置交通南山村位于東山島中心地帶，現(xiàn)已和西埔城區(qū)連在一起，村口就是縣主干公路東西一路通村前，東西二路貫通村后，村水泥路從村頭至村尾。
勞力資源全村青壯年勞動力736人，從事種菜、建筑裝修、物業(yè)管理、經(jīng)商收入。
經(jīng)濟(jì)社會村財主要靠土地開發(fā)收入，同時發(fā)展綠色蔬菜基地65畝，引進(jìn)樂安和南達(dá)兩個工業(yè)項目，開發(fā)興建南山村部綜合大樓，海魁、煙草、龍生、縣電大等企業(yè)在此落戶，呈現(xiàn)一派興旺發(fā)達(dá)、蒸蒸日上的繁榮景象。
基礎(chǔ)設(shè)施教育方面，文昌學(xué)村項目正在緊鑼密鼓的進(jìn)行。文化方面，擁有農(nóng)家書屋1間、籃球場1個；衛(wèi)生保障方面，設(shè)有村級衛(wèi)生所1所；民生保障方面，自來水戶戶通，安裝路燈30支，村內(nèi)建主干公路2條。
南山村與南埔村、古港村、前馬村、湖尾村、后馬村、下湖村、港西村、樟塘村相鄰。
南山村附近有東山風(fēng)動石景區(qū)、漳州馬鑾灣、漳州東山島、東山關(guān)帝廟、東山縣博物館、澳角村等旅游景點，有東山鮑魚、東山蘆筍、東山親營紫菜、墨魚干、水仙花、當(dāng)歸鴨面線等特產(chǎn)，有東山歌冊、東山關(guān)帝信俗、鐵枝木偶戲(東山縣）、東山海船釘造技術(shù)、東山海柳雕技藝、東山金木雕技藝等民俗文化。