地名由來：公元575年，移盱眙的北譙州于新昌城（今滁城），始稱南譙州，南譙這一地名開始于此。
2022年1月，國家林業(yè)和草原局認定命名南譙區(qū)麻櫟產業(yè)示范園區(qū)為第二批國家林業(yè)產業(yè)示范園區(qū)。
2021年12月，農業(yè)農村部認定南譙區(qū)為全國第六批率先基本實現主要農作物生產全程機械化示范縣（市、區(qū)）。
2021年5月，根據第七次全國人口普查結果，南譙區(qū)人口數量為34.88萬人，位列滁州市各縣市區(qū)人口數量排行榜第7位，位列安徽省各縣市區(qū)人口數量排行榜第70位，位列全國各縣市區(qū)人口數量排行榜第1545位。
2020年6月，南譙區(qū)列入第二批革命文物保護利用片區(qū)分縣名單（淮南片區(qū)）。
2020年4月，南譙區(qū)上榜第三屆安徽省文明城區(qū)名錄。
2018年11月，第一批安徽特色農產品優(yōu)勢區(qū)名單出爐，南譙區(qū)滁菊特色農產品優(yōu)勢區(qū)榜上有名。
2018年5月，南譙區(qū)被確定為第二批安徽省農產品質量安全縣。
南譙區(qū)位于蘇皖兩省交界處，東南隔江與南京市僅50公里，西距省會合肥在百公里之內，是安徽省“東向發(fā)展”戰(zhàn)略的橋頭堡，且腹地廣闊，承載力強，是融入南京都市圈、聯絡浦口區(qū)的前沿地帶。以風景秀麗的瑯琊山系為分界線，緊緊環(huán)抱皖東政治、經濟、文化中心——滁州市城區(qū)，處在沿海向內地過渡區(qū)域，是開發(fā)皖江、呼應“長三角”、聯絡大西部的前沿地帶，是城鄉(xiāng)互融的重要地區(qū)，是投資興業(yè)的理想場所。
南譙歷史悠久，源遠流長。秦、漢時期境屬九郡，南朝置南譙州，隋朝以后，境屬滁州。民國六年，滁州改為滁縣。1982年，撤銷滁縣設立縣級滁州市。1993年1月18日，經國務院批準，撤銷縣級滁州市，成立省轄地級滁州市，南譙成為滁州市兩個轄區(qū)之一。全區(qū)現轄8個鎮(zhèn)和3個街道辦事處，共計59個行政村，32個社區(qū)[25個城市社區(qū)（其中含大王十八里店社區(qū)）+7個農村社區(qū)]。
境內交通發(fā)達，京滬鐵路、-鐵路縱貫境內，馬滁揚高速公路、寧洛高速公路、正在建設中滁淮高速穿越境內。
近年來，南譙區(qū)相繼榮獲全國林權改革百強縣、全國綠化模范縣（市區(qū)）、全國科技進步縣（市區(qū)）、全國計劃生育優(yōu)質服務先進縣（市區(qū)）、全國義務教育發(fā)展基本均衡縣（市區(qū)）、全國學前教育先進縣（市區(qū)）、全國群眾體育先進單位、全國文化先進區(qū)、全國茶葉百強縣、全省知識產權強縣工作示范縣（市區(qū)）；安徽省苗木產業(yè)基地縣、安徽省森林城市、安徽省林業(yè)產業(yè)十強縣（市區(qū)）、安徽省平安區(qū)、安徽省文明城區(qū)、安徽省民間文化藝術之鄉(xiāng)等“國字號”“省字號”榮譽稱號。人口計生工作連續(xù)六年獲省級表彰；水利工作連續(xù)八年在省“江淮杯”評比中榜上有名。同時，施集鎮(zhèn)被授予省級生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號，烏衣、沙河、章廣、大柳等鎮(zhèn)獲省級森林城鎮(zhèn)稱號，章廣鎮(zhèn)還獲首批省級現代林業(yè)示范區(qū)、安徽特色景觀旅游名鎮(zhèn)稱號，大柳鎮(zhèn)獲安徽優(yōu)秀旅游鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號，新塘村、姑塘村獲“全國文明村（鎮(zhèn)）”稱號，黃圩村、曲亭村被評為“首批中國鄉(xiāng)村旅游模范村”等。
近年來，南譙區(qū)在省委省政府、市委市政府的堅強領導下，積極踐行新發(fā)展理念，城鄉(xiāng)面貌日新月異，經濟發(fā)展和各項社會事業(yè)蒸蒸日上，形成了以裝備制造、智能家電、新建材、食品等為主導的現代產業(yè)體系。先后榮獲全國集體林權改革百強縣（區(qū)）、全國計劃生育優(yōu)質服務先進區(qū)、全國義務教育發(fā)展均衡區(qū)、全國文化先進區(qū)等“國字號”稱號。
歷史沿革：
春秋戰(zhàn)國時期境為棠邑。
兩晉時期屬頓丘縣。
陳太建七年（575），移盱眙的北譙州于新昌城，始稱南譙州。
明洪武二十二年（1389），為滁州直隸州。
1912年，實行省管縣，廢滁州為滁縣。
1914年6月，屬安慶道，10月屬淮泗道。
1928年8月，廢道，直屬安徽省。
1943年2月，全椒縣部分區(qū)鄉(xiāng)劃入，改為滁全縣，11月復為滁縣。
1945年8月，復置滁全縣。
1949年，滁城解放。
1949年，中華人民共和國成立之后，滁縣屬皖北人民行署滁縣行政區(qū)。
1952年4月，屬安徽省滁縣專區(qū)。
1956年1月，撤銷滁縣專區(qū)，改屬安徽省蚌埠專區(qū)。
1961年3月，復屬滁縣專區(qū)。
1973年3月，屬安徽省滁縣地區(qū)。
1982年11月，國務院批準撤銷滁縣，以原滁縣行政區(qū)域改設滁州市（縣級），區(qū)域屬滁州市。
1982年2月，正式建立縣級滁州市，隸屬安徽省滁縣地區(qū)。
1992年12月20日，撤原滁州市，設南譙區(qū)。