地名由來(lái)：北宋元符元年（1098）由寧化縣、長(zhǎng)汀縣析置，以溪流回環(huán)清澈故名；另說(shuō)另說(shuō)以縣治有龍津河流水清澈命名；又說(shuō)因縣北有清溪，沿溪山林茂密,溪水澄清似練,故名；據(jù)《中國(guó)地名辭源》：因江水清澈得名。
2021年10月，福建省人民政府發(fā)展研究中心發(fā)布2021年度福建省經(jīng)濟(jì)發(fā)展“十佳”縣（市），清流縣榜上有名。
2021年5月，根據(jù)第七次全國(guó)人口普查結(jié)果，清流縣人口數(shù)量為11.8萬(wàn)人，位列三明市各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第9位，位列福建省各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第81位，位列全國(guó)各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第2524位。
2021年2月，福建省2018-2020年度省級(jí)文明城市名單出爐，清流縣上榜。
2020年3月，清流縣獲得2019年全國(guó)村莊清潔行動(dòng)先進(jìn)縣稱號(hào)。
2019年8月，緊密型縣域醫(yī)療衛(wèi)生共同體建設(shè)試點(diǎn)縣名單出爐，清流縣榜上有名。
2019年3月，清流縣列入第一批革命文物保護(hù)利用片區(qū)分縣名單（原中央蘇區(qū)片區(qū)）。
2016年2月，農(nóng)業(yè)部和國(guó)家安全監(jiān)管總局確定清流縣為2014—2015年度全國(guó)平安漁業(yè)示范縣。
清流縣地處福建省西部，武夷山南側(cè)，九龍溪上游，東臨永安，南接連城，西北與寧化毗鄰，東北與明溪接壤，通行閩客方言清寧話。清流屬中亞熱帶季風(fēng)氣候，年平均氣溫17.9℃，年平均降雨量1738毫米。北緯25°48″到26°21″，東經(jīng)116°38′到117°10′，平均海拔350米。全縣總面積1825平方公里，轄14個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)和1個(gè)開發(fā)區(qū)、111個(gè)行政村、7個(gè)居委會(huì)，總?cè)丝?5.6萬(wàn)。
清流城區(qū)清流歷史悠久，古稱黃蓮，宋元符元年（1098年）置縣至今已911年，因縣城清溪環(huán)繞，碧水縈回，故名清流?？脊艑W(xué)家在沙蕪狐貍洞發(fā)現(xiàn)古人類化石，填補(bǔ)了福建省舊石器時(shí)-古空白，把福建人類的活動(dòng)歷史由六、七千年前推進(jìn)到一萬(wàn)年以前，成為“閩人之源”。
民族英雄文天祥曾途經(jīng)清流寫下了“山高不礙乾坤眼，地小能容宰相身”的稱贊詩(shī)句。唐朝開國(guó)元?jiǎng)棕┫嗍挰r、明朝吏部尚書裴應(yīng)章、我國(guó)著名的軍事防化專家黃新民、中國(guó)大提琴奠基者王連三等歷史精英祖籍都是清流。清流是客家祖地之一，客家先祖黃連鎮(zhèn)將巫羅俊在這里墾荒辟土，東漢黃香、唐代重臣魏征、唐代名將羅成等的后裔在沙蕪、嵩口、里田等鄉(xiāng)鎮(zhèn)繁衍生息。清流是第二次國(guó)內(nèi)革命戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期全國(guó)21個(gè)中央蘇區(qū)縣之一，在這片紅色土地上，曾留下毛澤東、朱德、彭德懷等老一輩無(wú)產(chǎn)階級(jí)革命家的戰(zhàn)斗足跡；1930年毛澤東同志途經(jīng)清流時(shí)，寫下了著名的《如夢(mèng)令•元旦》詩(shī)詞。
農(nóng)副產(chǎn)品有稻米，黃豆、花生，油茶籽、油桐籽、烤煙、茶葉、大蒜（賴坊、沙蕪白塔大蒜馳名），松脂、香菇，酸棗、梨、柑橘，藥材（淮山、烏桕等），兔毛、厘竹、毛邊紙。工業(yè)有煤炭、林產(chǎn)化工、冶金、水泥、森工、水電、農(nóng)機(jī)等門類。傳統(tǒng)名產(chǎn)剪刀、鉆子。
主要城鎮(zhèn)——龍津：縣人民政府駐地，譽(yù)稱“花園城”。嵩口：水陸交通方便。嵩溪：周圍鎢礦資源豐富，省行洛坑鎢礦在此。沙蕪：處安砂電站庫(kù)區(qū)，素稱“清流魚米鄉(xiāng)”。靈地：集市繁盛。李家：省試驗(yàn)草場(chǎng)設(shè)此，省烏桕生產(chǎn)基地之一。林畬：盛產(chǎn)中藥淮山?！?p>城區(qū)有明代尚書府，游覽地清苑、北山公園。龍津望月、西橋橫笛、北渡孤舟、灞涌金蓬、三港觀魚、古景新姿，引人入勝。嵩口、安砂水庫(kù)是兩個(gè)瑰麗恬靜的高峽平湖是新辟旅游勝地。賴坊大豐山景區(qū)，奇峰突兀，千山環(huán)拱，有“七里不見天”的遮蔭石徑、棲息松林間的白鶴群猴，屹立大山巔的順真道院。沙蕪狐貍洞古人類“清流人”下臼齒化石把福建人類歷史推至一萬(wàn)年前。里田有1930年朱毛紅軍鍋蒙山戰(zhàn)役紀(jì)念地。
生態(tài)資源方面
全縣耕地15.27萬(wàn)畝，林業(yè)用地234萬(wàn)畝，森林覆蓋率84%，木材蓄積量1200多萬(wàn)立方米，是全國(guó)商品糧基地縣、全國(guó)重點(diǎn)林業(yè)縣和全國(guó)農(nóng)村初級(jí)電氣化縣.有大豐山省級(jí)森林公園、蓮花山省級(jí)自然保護(hù)區(qū)等。主要農(nóng)產(chǎn)品有烤煙、花卉、苗木、水果、豆腐皮、魚干、茶葉、精制茶油等，特別是苗木花卉產(chǎn)業(yè)正在興起，已形成各類珍稀苗木2.1萬(wàn)畝、鮮切花2000多畝種植規(guī)模，其中有桂花10萬(wàn)株，是我國(guó)南方桂花重要基地；種植羅漢松200萬(wàn)株，是全國(guó)最大的羅漢松生產(chǎn)基地。
歷史沿革：
清流，古屬黃連峒。
周、春秋末為閩越地。
秦屬閩中郡。
漢屬閩越。
東漢屬會(huì)稽南郡。
三國(guó)屬建安郡。
晉為新羅縣，地屬晉安郡。
隋開皇（581-600）并入邵武縣。
唐開元二十六年（738），改屬汀州府龍巖縣。
后唐為長(zhǎng)汀、寧化兩縣地，屬汀州府。
五代初屬閩王，后屬南唐。
后晉屬寧化麻倉(cāng)里，設(shè)清流驛。
宋元符元年（1098），劃寧化六團(tuán)里、長(zhǎng)汀二團(tuán)里置清流縣，屬汀州府。
縣治設(shè)坊郭里，后稱城關(guān)。
紹定元年（1228），撤銷縣建置。
元至元八年（1271），恢復(fù)清流縣建置，屬汀州路。
明洪武元年（1368），汀州路改為汀州府，清流屬汀州府。
清代屬福建汀州府。
1912年屬福建省西路道。
1914年，屬汀樟道。
1931年屬中央蘇區(qū)。
1933年11月至1934年2月，十九路軍將領(lǐng)蔡廷鍇發(fā)動(dòng)“福建事變”，成立中華共和國(guó)人民革命政府，及福建人民政府，將福建劃為4個(gè)省，清流屬龍漳省。
1934年3月后，屬福建省第八行政督察專員公署。
1935年10月，屬福建省第七行政督察區(qū)。
1946年屬福建省第九行政督察區(qū)。
1947年7月，屬福建省第六行政督察區(qū)。
1950年2月，屬福建省人民政府永安專員公署。
全縣設(shè)3區(qū)，轄42個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。
1956年5月，并入龍巖專員公署。
1958年5月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，全縣并為1鎮(zhèn)15鄉(xiāng)。
同年10月，各鄉(xiāng)鎮(zhèn)改稱人民公社。
1959年2月，清流、寧化合并，稱清寧縣。
原清流縣轄區(qū)設(shè)6個(gè)公社、8個(gè)管理區(qū)。
1961年6月，恢復(fù)清流縣建置，屬龍巖專員公署，設(shè)14個(gè)公社。
1963年5月，屬三明專員公署。
1968年，屬三明地區(qū)革命委員會(huì)。
1968年11月，成立清流縣革命委員會(huì)，屬三明地區(qū)管轄，設(shè)14個(gè)公社革命委員會(huì)。
1980年10月，清流縣革命委員會(huì)改稱清流縣人民政府，屬三明專員公署。
1982年3月，全縣設(shè)14個(gè)公社鎮(zhèn)管理委員會(huì)1個(gè)鎮(zhèn)人民政府。
1983年4月至今，屬三明市。