地名由來(lái)：因地處石馬尾部得名；據(jù)《中國(guó)古今地名大詞典》：閩江下游有浮礁似駿馬，礁西為馬頭江，礁東為馬尾江，舊鎮(zhèn)中岐位于馬尾江邊，故名馬尾。
2021年10月，2021年度全國(guó)新型城鎮(zhèn)化質(zhì)量百?gòu)?qiáng)區(qū)名單發(fā)布，馬尾區(qū)名列第87。
2021年10月，2021年度全國(guó)科技創(chuàng)新百?gòu)?qiáng)區(qū)名單發(fā)布，馬尾區(qū)名列第67。
2021年8月，馬尾區(qū)上榜2021中國(guó)高質(zhì)量發(fā)展百?gòu)?qiáng)區(qū)（地級(jí)市市轄區(qū)），位列第56位。
2021年6月，馬尾區(qū)上榜2021中國(guó)生活品質(zhì)百優(yōu)縣市，位列第51。
2021年5月，根據(jù)第七次全國(guó)人口普查結(jié)果，馬尾區(qū)人口數(shù)量為29.1萬(wàn)人，位列福州市各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第9位，位列福建省各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第55位，位列全國(guó)各縣市區(qū)人口數(shù)量排行榜第1794位。
2021年2月，福建省2018-2020年度省級(jí)文明城市名單出爐，馬尾區(qū)上榜。
2020年12月，馬尾區(qū)上榜2020年全國(guó)新城區(qū)綜合競(jìng)爭(zhēng)力百?gòu)?qiáng)，排名第45。
馬尾區(qū)位于東經(jīng)119°37′，北緯25°29′。地處福州市東南部，閩江下游北岸，距閩江口17海里。東瀕閩江，西與晉安區(qū)接壤，南與倉(cāng)山區(qū)、長(zhǎng)樂(lè)區(qū)隔江相望，東北毗鄰連江縣，地勢(shì)西北高東南低。土地面積26435.48公頃，海域面積約44平方千米。
【土地資源】2021年，馬尾區(qū)面積26435.48公頃。其中濕地為2061.9公頃，耕地939.5公頃，種植園用地806.3公頃，林地14771.73公頃，草地221.62公頃，城鎮(zhèn)村及工礦用地3654.76公頃，交通運(yùn)輸用地1011.59公頃，水域及水利設(shè)施用地2547.58公頃，其他土地420.5公頃。
【礦產(chǎn)資源】2021年，馬尾區(qū)發(fā)現(xiàn)礦產(chǎn)資源8種。金屬礦有釷礦、釷鈮礦、鈮釷礦、鐵錳礦4種4處，為礦化點(diǎn)，遠(yuǎn)景差。非金屬礦有高嶺土礦、河砂礦、礦泉水、花崗巖石材礦4種10處。其中河砂礦位于海砂開(kāi)采區(qū)域的禁采線范圍內(nèi)，屬禁止開(kāi)采礦種；高嶺土礦點(diǎn)規(guī)模小，工作程度低，不具遠(yuǎn)景；唯一可使用的建筑用石料，資源豐富，受“三區(qū)兩線”限制影響，工作程度不高，資源儲(chǔ)量不明確。年內(nèi)，全區(qū)沒(méi)有批準(zhǔn)開(kāi)采的礦山。
【森林資源】2021年，馬尾區(qū)林業(yè)用地面積14953.17公頃，按保護(hù)等級(jí)分為生態(tài)公益林面積11705.48公頃（其中國(guó)家級(jí)公益林9349.81公頃，省級(jí)公益林2355.67公頃）、商品林面積3247.69公頃。天然林4609.01公頃，其中天然商品林774.51公頃。按地類(lèi)分：有林地面積13299.24公頃，疏林地面積331.17公頃，灌木林地面積865.41公頃，未成林地面積86.42公頃。森林蓄積量84.44萬(wàn)立方米，森林覆蓋率47.18%。植被屬南亞熱帶雨林小區(qū)，經(jīng)鑒定的有126科304屬430種，其中蕨類(lèi)16科21屬26種，裸子植物6科11屬19種，被子植物104科272屬385種；按生活型分，喬木154種，灌木106種，草本148種，藤本22種；屬?lài)?guó)家二級(jí)保護(hù)的樹(shù)種有香樟、建柏、金毛狗等，零星分布于區(qū)內(nèi)。
【濕地資源】2021年，福建馬尾閩江河口濕地省級(jí)自然保護(hù)區(qū)總面積869公頃，其中緩沖區(qū)面積447公頃，占保護(hù)區(qū)總面積的51.44%；實(shí)驗(yàn)區(qū)面積422公頃，占保護(hù)區(qū)總面積的48.56%。濕地各類(lèi)型面積：河口水域400.6公頃，潮間帶泥灘467公頃，島嶼（1個(gè)）1.4公頃。主要保護(hù)對(duì)象為重點(diǎn)濱海濕地生態(tài)系統(tǒng)和水鳥(niǎo)資源，植物資源主要分布在白猴嶼島上。
【海洋資源】2021年，馬尾區(qū)海域面積約44平方千米，海岸線58千米；海島8個(gè)，其中居民海島1個(gè)。海域底棲生物近170種，其中軟體類(lèi)近80種，甲殼類(lèi)近50種。區(qū)內(nèi)浮游植物主要有藍(lán)藻門(mén)、綠藻門(mén)、裸藻門(mén)、金藻門(mén)、硅藻門(mén)、甲藻門(mén)六大類(lèi)65種，其中硅藻門(mén)浮游植物居多。浮游動(dòng)物主要有腔腸動(dòng)物門(mén)、環(huán)節(jié)動(dòng)物門(mén)、毛顎動(dòng)物門(mén)、節(jié)肢動(dòng)物門(mén)、脊索動(dòng)物門(mén)五大門(mén)類(lèi)，其中橈足類(lèi)最多，有20多種；其次為水母，有10多種；枝角類(lèi)主要有小擬哲水蚤、四刺窄腹水蚤、蔓足類(lèi)幼體、捷氏歪水蚤、火腿許水蚤等。海產(chǎn)魚(yú)類(lèi)及其他海生動(dòng)物多產(chǎn)于瑯岐東南部閩江口，海水養(yǎng)殖主要品種有鱸魚(yú)、南美白對(duì)蝦、鋸緣青蟹、文蛤、縊蟶等。淡水養(yǎng)殖主要品種有草魚(yú)、青魚(yú)、鰱魚(yú)、鳙魚(yú)、鯉魚(yú)、鯽魚(yú)、鳊魴、羅非魚(yú)、鰻鱺等，其中草魚(yú)、鰱、鳙為當(dāng)?shù)厝斯ゐB(yǎng)殖的傳統(tǒng)品種，南美白對(duì)蝦為區(qū)重要養(yǎng)殖品種。
【水資源】2021年，馬尾區(qū)內(nèi)閩江過(guò)境長(zhǎng)度37千米，支流有磨溪、馬鞍溪、水塘溪、雙頭溪、三合溪、上溪、水帶溪等14條溪流，河汊縱橫，形成網(wǎng)狀水系，溪流總平均逕流量1.95億立方米。地下水資源較貧乏，主要有松散堆積層孔隙水、風(fēng)化層孔隙裂隙水、基巖裂隙水3種類(lèi)型，除瑯岐島個(gè)別地區(qū)水質(zhì)屬咸水、半咸水與山區(qū)地帶水質(zhì)含氟鐵外，其余水質(zhì)均良好。
歷史沿革：
馬尾歷史悠久，西周時(shí)，境內(nèi)屬七閩地。
秦時(shí)屬閩中郡。
西漢時(shí)屬東冶，東漢光帝建武元年（公元25年）各地商船經(jīng)過(guò)馬尾來(lái)往福州，開(kāi)始了水上貿(mào)易，馬尾一帶人口漸繁。
屬侯官。
晉代屬原豐縣，從隋朝至清末，屬閩縣。
民國(guó)時(shí)期歸屬閩侯縣管轄。
唐乾元元年（758年），長(zhǎng)樂(lè)郡改為福州，領(lǐng)閩縣、侯官等8縣。
宋太平興國(guó)六年（981年），今馬尾地區(qū)分別歸屬晉安東鄉(xiāng)和安仁鄉(xiāng)。
元明時(shí)期不變。
明憲宗成化十年（1474年）市舶司從泉州移設(shè)福州，琉球商人紛紛經(jīng)馬尾赴榕，馬尾港的地位更為突出。
清代末年，閩縣撤鄉(xiāng)建區(qū)，共分為11區(qū)，今馬尾地區(qū)分別屬于琯江區(qū)，馬江區(qū)，嘉嶼區(qū)。
1980年鴉片戰(zhàn)爭(zhēng)，各國(guó)兵商船來(lái)福州均停泊于馬尾港。
1866年，洋務(wù)派在馬尾創(chuàng)辦船政。
1884年在馬尾爆發(fā)中法海戰(zhàn)。
民國(guó)初叫馬江鎮(zhèn)，解放前屬林森縣第二區(qū)，設(shè)馬江鎮(zhèn)公所。
1949年馬尾區(qū)解放。
1951年設(shè)馬尾鎮(zhèn)人民政府，屬閩侯縣第三區(qū)公所。
1982年設(shè)馬尾區(qū)，直屬福州市。
1984年在馬尾設(shè)立經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)。
1991年3月國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)設(shè)立福州高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)馬尾科技園。
1992年11月國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)在馬尾設(shè)立福州保稅區(qū)。
1993年1月國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)福州經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)沿閩江北岸向快安延伸，1995年12月馬尾街道更名為羅星街道，1996年馬尾區(qū)轄羅星街道和馬尾、亭江、瑯岐三鎮(zhèn)。
2000年設(shè)立瑯岐經(jīng)濟(jì)區(qū)，并沿用至今。